Augmenter la difficulté de l'intervention chirurgicale : Le principal inconvénient de la laparoscopie à un seul orifice est l'augmentation de la difficulté opératoire. Dans la laparoscopie à un seul orifice, ou laparoscopie monoporte, comme tous les instruments chirurgicaux pénètrent par un seul canal, l'espace opératoire est restreint, les instruments se croisent entre eux, et il est facile que ceux-ci s'entremêlent, ce qui est appelé " effet des baguettes ". En particulier, lors de la suture sous microscope, l'opération ne peut être réalisée, la plupart du temps, qu'avec une seule main.
Exigences élevées envers le chirurgien : étant donné que les instruments chirurgicaux se trouvent souvent sur la même ligne parallèle que l'objectif, dans la laparoscopie monoporte, la zone triangulaire propre à la laparoscopie conventionnelle disparaît. Ainsi, le chirurgien doit réapprendre à ressentir précisément la position des instruments et la profondeur des structures anatomiques, ce qui diminue la précision opératoire. De plus, les instruments utilisés pendant l'intervention peuvent facilement obstruer l'objectif. Parfois, afin de tenir compte du mouvement des instruments, l'objectif doit faire des concessions appropriées, ce qui rend difficile d'obtenir le meilleur champ visuel chirurgical.
Par conséquent, la laparoscopie à un seul orifice exige des compétences et une maîtrise supérieures de la part de l'opérateur, ce qui rend l'intervention plus difficile et plus longue. Cela limite également, dans une certaine mesure, l'application large de la laparoscopie à un seul orifice.
